Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM21P19474 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM21P19474 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms