Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TMIGD3P0DMS9 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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