Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLIN3O60664 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLIN3O60664 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLIN3O60664 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLIN3O60664 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLIN3O60664 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLIN3O60664 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLIN3O60664 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLIN3O60664 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLIN3O60664 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLIN3O60664 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PLIN3O60664 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLIN3O60664 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLIN3O60664 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLIN3O60664 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.5 ms