Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ITM2AO43736 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms