Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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UBXN8O00124 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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UBXN8O00124 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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UBXN8O00124 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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UBXN8O00124 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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UBXN8O00124 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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UBXN8O00124 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN8O00124 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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