Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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