Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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