Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF17Q9BXT8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF17Q9BXT8 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms