Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUP58Q9BVL2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms