Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTA3Q9BTC8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTA3Q9BTC8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms