Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LPIN3Q9BQK8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms