Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms