Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP3Q8WYN3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms