Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD42Q8N9B4 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms