Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APTXQ7Z2E3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms