Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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