Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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C9orf50Q5SZB4 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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C9orf50Q5SZB4 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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