Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RNF212Q495C1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms