Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DDB1Q16531 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms