Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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ZFHX3Q15911 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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ZFHX3Q15911 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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ZFHX3Q15911 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ZFHX3Q15911 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ZFHX3Q15911 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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