Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms