Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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