Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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NAE1Q13564 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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