Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms