Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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