Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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