Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC8Q09428 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms