Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK16Q00536 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms