Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms