Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms