Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGA6P23229 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms