Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FGFR4P22455 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FGFR4P22455 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms