Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF3P18847 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF3P18847 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF3P18847 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF3P18847 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms