Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
VPREB1P12018 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms