Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms