Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms