Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms