Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TARSL2A2RTX5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TARSL2A2RTX5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms