Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NDUFA12Q9UI09 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms