Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SH3BP4Q9P0V3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP4Q9P0V3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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