Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
COMMD9Q9P000 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
COMMD9Q9P000 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms