Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms