Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2BQ99453 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms