Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CDRT15Q96T59 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CDRT15Q96T59 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CDRT15Q96T59 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CDRT15Q96T59 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CDRT15Q96T59 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CDRT15Q96T59 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CDRT15Q96T59 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CDRT15Q96T59 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDRT15Q96T59 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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