Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SIN3AQ96ST3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms