Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAAF3Q8N9W5 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.7 ms