Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLASP1Q7Z460 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLASP1Q7Z460 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms