Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBAP2Q5T6F2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms