Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01588-203ENST00000529902 4279 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC2A5-202ENST00000377424 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms