Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF2Q5BJF6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms